El gener del 2006, la Força Internacional d'Assistència a la Seguretat (ISAF) es va desplegar a l'Afganistan per ajudar els militars nord-americans i britànics en la lluita contra els talibans paramilitars islamistes. El govern dels Estats Units va acusar els talibans d’acollir el cap d’Al-Qaeda, Osama bin Laden, i va exigir la seva extradició. La direcció talibana es va negar a complir aquesta demanda, dient que els Estats Units no van proporcionar proves de la culpabilitat d'Osama en els atacs de l'11 de setembre de 2001.
A finals del 2001, l'estructura militar dels talibans estava pràcticament destruïda i la resistència dels seus partidaris es va convertir en un moviment guerriller. Els països occidentals han invertit molt en el desenvolupament de la democràcia i l'estructura social de l'Afganistan. El 2004, Hamid Karzai, un polític prou fidel a Occident, va guanyar les primeres eleccions presidencials del país. No obstant això, la resistència dels partidaris dels talibans no va poder ser suprimida. Els guerrillers van lluitar aferrissadament malgrat l’aclaparadora superioritat militar de la ISAF.
França, com altres membres de l’aliança, va patir pèrdues d’equips i mà d’obra. Durant els deu anys de guerra a l'Afganistan, 83 soldats van morir i diverses vegades van resultar ferits. La decisió d’implicar França en l’operació militar no va ser molt popular entre la població i els informes de baixes entre soldats francesos van augmentar el descontentament amb el govern.
El 20 de gener de 2012, a la província de Kapisa, un home amb uniforme de l'exèrcit afganès va disparar a 4 i va ferir 16 soldats francesos. Després d'això, Nicolas Sarkozy (president francès del 2007 al 2012) va dir que, atès que el govern afganès no pot garantir la seguretat de les tropes franceses, França suspèn la seva presència militar en aquest país. Sarkozy va prometre retirar tropes de l'Afganistan a principis del 2014.
El 2012, François Hollande va ser elegit president de França, que va anunciar un nou pla per retirar-se de l'Afganistan. 2.000 soldats seran retirats a finals del 2012, 1.400 en queden com a instructors i per protegir les instal·lacions socials. El president va explicar la seva decisió pel fet que el perill dels terroristes ha disminuït, la democràcia s'ha fet més forta i el país ha de desenvolupar-se independentment. El cap de la república va prometre que França continuaria donant suport a l'Afganistan, però en una forma diferent.
